Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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