Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms