Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms