Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms