Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms