Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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