Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Krt77Q6IFZ6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Krt77Q6IFZ6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Krt77Q6IFZ6 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Krt77Q6IFZ6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Krt77Q6IFZ6 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Krt77Q6IFZ6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Krt77Q6IFZ6 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Krt77Q6IFZ6 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krt77Q6IFZ6 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Krt77Q6IFZ6 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.8 ms