Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Kiaa1549Q68FD9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms