Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sbno1Q689Z5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sbno1Q689Z5 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sbno1Q689Z5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sbno1Q689Z5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sbno1Q689Z5 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sbno1Q689Z5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sbno1Q689Z5 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168 ms