Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trim28Q62318 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trim28Q62318 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trim28Q62318 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trim28Q62318 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trim28Q62318 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trim28Q62318 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trim28Q62318 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trim28Q62318 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trim28Q62318 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Trim28Q62318 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Trim28Q62318 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Trim28Q62318 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms