Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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