Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms