Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms