Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms