Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b2Q3UJB0 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms