Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms