Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms