Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Zic3-201ENSMUST00000088627 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms