Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Treml4Q3LRV9 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms