Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms