Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Kcnma1Q08460 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Kcnma1Q08460 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Kcnma1Q08460 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Kcnma1Q08460 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Kcnma1Q08460 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Kcnma1Q08460 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Kcnma1Q08460 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Kcnma1Q08460 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Kcnma1Q08460 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Kcnma1Q08460 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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