Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms