Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Cntn3Q07409 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Cntn3Q07409 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Cntn3Q07409 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Cntn3Q07409 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Cntn3Q07409 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Cntn3Q07409 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Cntn3Q07409 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Cntn3Q07409 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Cntn3Q07409 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Cntn3Q07409 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Cntn3Q07409 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Cntn3Q07409 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Cntn3Q07409 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Cntn3Q07409 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cntn3Q07409 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cntn3Q07409 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cntn3Q07409 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cntn3Q07409 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cntn3Q07409 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cntn3Q07409 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cntn3Q07409 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cntn3Q07409 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cntn3Q07409 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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