Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Thbs3Q05895 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Thbs3Q05895 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms