Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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NfiaQ02780 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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NfiaQ02780 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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