Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GscQ02591 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms