Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms