Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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