Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Top2aQ01320 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Top2aQ01320 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Top2aQ01320 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Top2aQ01320 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Top2aQ01320 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Top2aQ01320 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Top2aQ01320 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Top2aQ01320 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Top2aQ01320 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Top2aQ01320 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Top2aQ01320 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Top2aQ01320 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Top2aQ01320 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.1 ms