Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms