Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms