Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Smn1P97801 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Smn1P97801 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Smn1P97801 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Smn1P97801 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Smn1P97801 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Smn1P97801 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Smn1P97801 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Smn1P97801 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Smn1P97801 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Smn1P97801 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smn1P97801 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms