Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Usp9xP70398 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Usp9xP70398 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Usp9xP70398 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Usp9xP70398 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
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Usp9xP70398 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Usp9xP70398 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Usp9xP70398 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Usp9xP70398 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Usp9xP70398 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Usp9xP70398 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9xP70398 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
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