Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkn1P70268 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn1P70268 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms