Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nphp4P59240 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms