Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Cldn18P56857 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Cldn18P56857 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms