Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TgfaP48030 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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