Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PpargP37238 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpargP37238 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpargP37238 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpargP37238 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpargP37238 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms