Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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