Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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RxraP28700 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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RxraP28700 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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RxraP28700 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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RxraP28700 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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RxraP28700 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RxraP28700 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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RxraP28700 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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RxraP28700 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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RxraP28700 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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