Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms