Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Myo5bP21271 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms