Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms