Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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PcnaP17918 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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PcnaP17918 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms