Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms