Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CtsbP10605 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms