Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms