Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MscO88940 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms