Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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