Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Prrt1O35449 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Prrt1O35449 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Prrt1O35449 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Prrt1O35449 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Prrt1O35449 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prrt1O35449 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prrt1O35449 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prrt1O35449 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prrt1O35449 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prrt1O35449 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prrt1O35449 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Prrt1O35449 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Prrt1O35449 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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